Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Herc4Q6PAV2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc4Q6PAV2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Herc4Q6PAV2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Herc4Q6PAV2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Herc4Q6PAV2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms