Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sik3Q6P4S6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sik3Q6P4S6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sik3Q6P4S6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sik3Q6P4S6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sik3Q6P4S6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms