Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig3Q6P1C6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrig3Q6P1C6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lrig3Q6P1C6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig3Q6P1C6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig3Q6P1C6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms