Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1l1Q6NZP2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms