Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sec23ipQ6NZC7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sec23ipQ6NZC7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sec23ipQ6NZC7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec23ipQ6NZC7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms