Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Szrd1Q6NXN1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Szrd1Q6NXN1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Szrd1Q6NXN1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Szrd1Q6NXN1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms