Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RragbQ6NTA4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RragbQ6NTA4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RragbQ6NTA4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RragbQ6NTA4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms