Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep78Q6IRU7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cep78Q6IRU7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cep78Q6IRU7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms