Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Carmil1Q6EDY6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Carmil1Q6EDY6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Carmil1Q6EDY6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Carmil1Q6EDY6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Carmil1Q6EDY6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Carmil1Q6EDY6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Carmil1Q6EDY6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Carmil1Q6EDY6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Carmil1Q6EDY6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Carmil1Q6EDY6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Carmil1Q6EDY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Carmil1Q6EDY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Carmil1Q6EDY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Carmil1Q6EDY6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Carmil1Q6EDY6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Carmil1Q6EDY6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms