Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx3Q64704 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx3Q64704 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stx3Q64704 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stx3Q64704 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms