Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprdQ64487 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtprdQ64487 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PtprdQ64487 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprdQ64487 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms