Protein–RNA interactions for Protein: Q64332

Syn2, Synapsin-2, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn2Q64332 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syn2Q64332 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syn2Q64332 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syn2Q64332 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syn2Q64332 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syn2Q64332 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms