Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf4Q64287 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf4Q64287 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf4Q64287 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf4Q64287 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf4Q64287 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf4Q64287 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf4Q64287 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms