Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gdpd5Q640M6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gdpd5Q640M6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd5Q640M6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpd5Q640M6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms