Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc18Q640L5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc18Q640L5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc18Q640L5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ccdc18Q640L5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc18Q640L5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc18Q640L5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc18Q640L5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Ccdc18Q640L5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc18Q640L5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Ccdc18Q640L5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Ccdc18Q640L5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Ccdc18Q640L5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Ccdc18Q640L5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
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