Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Vil1Q62468 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Vil1Q62468 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Vil1Q62468 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vil1Q62468 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vil1Q62468 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vil1Q62468 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vil1Q62468 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Vil1Q62468 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vil1Q62468 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vil1Q62468 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Vil1Q62468 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vil1Q62468 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vil1Q62468 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vil1Q62468 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Vil1Q62468 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Vil1Q62468 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Vil1Q62468 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vil1Q62468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vil1Q62468 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vil1Q62468 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vil1Q62468 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Vil1Q62468 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vil1Q62468 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vil1Q62468 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms