Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vat1Q62465 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vat1Q62465 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vat1Q62465 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vat1Q62465 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vat1Q62465 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 804 ms