Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smad2Q62432 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smad2Q62432 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smad2Q62432 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smad2Q62432 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms