Protein–RNA interactions for Protein: Q62419

Sh3gl1, Endophilin-A2, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl1Q62419 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl1Q62419 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl1Q62419 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sh3gl1Q62419 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3gl1Q62419 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3gl1Q62419 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms