Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ss18Q62280 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ss18Q62280 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ss18Q62280 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms