Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sprr1bQ62267 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sprr1bQ62267 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sprr1bQ62267 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sprr1bQ62267 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms