Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sycp1Q62209 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sycp1Q62209 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sycp1Q62209 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sycp1Q62209 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sycp1Q62209 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms