Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Scn9aQ62205 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Scn9aQ62205 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scn9aQ62205 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Scn9aQ62205 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn9aQ62205 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Scn9aQ62205 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn9aQ62205 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Scn9aQ62205 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms