Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SelplgQ62170 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SelplgQ62170 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SelplgQ62170 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms