Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lrrn1Q61809 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lrrn1Q61809 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrn1Q61809 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrn1Q61809 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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