Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pacsin1Q61644 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pacsin1Q61644 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pacsin1Q61644 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pacsin1Q61644 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pacsin1Q61644 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms