Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pde3bQ61409 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde3bQ61409 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pde3bQ61409 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pde3bQ61409 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Pde3bQ61409 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pde3bQ61409 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pde3bQ61409 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Pde3bQ61409 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pde3bQ61409 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pde3bQ61409 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pde3bQ61409 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms