Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna1eQ61290 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna1eQ61290 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna1eQ61290 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacna1eQ61290 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacna1eQ61290 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms