Protein–RNA interactions for Protein: Q61137

Astn1, Astrotactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn1Q61137 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Astn1Q61137 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Astn1Q61137 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Astn1Q61137 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Astn1Q61137 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Astn1Q61137 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Astn1Q61137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Astn1Q61137 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Astn1Q61137 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Astn1Q61137 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Astn1Q61137 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms