Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lamb3Q61087 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lamb3Q61087 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lamb3Q61087 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lamb3Q61087 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms