Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp7Q60973 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rbbp7Q60973 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rbbp7Q60973 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbbp7Q60973 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.7 ms