Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Meis1Q60954 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Meis1Q60954 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Meis1Q60954 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Meis1Q60954 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms