Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cep250Q60952 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cep250Q60952 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cep250Q60952 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cep250Q60952 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms