Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cnot7Q60809 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cnot7Q60809 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cnot7Q60809 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnot7Q60809 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms