Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stxbp3Q60770 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stxbp3Q60770 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Stxbp3Q60770 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Stxbp3Q60770 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stxbp3Q60770 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms