Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcl17Q5UW37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcl17Q5UW37 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcl17Q5UW37 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cxcl17Q5UW37 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cxcl17Q5UW37 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cxcl17Q5UW37 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms