Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc5a6Q5U4D8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc5a6Q5U4D8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Slc5a6Q5U4D8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Slc5a6Q5U4D8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms