Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r195Q5SVD6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmn1r195Q5SVD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms