Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc42Q5SV66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc42Q5SV66 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc42Q5SV66 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc42Q5SV66 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms