Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Psme4Q5SSW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Psme4Q5SSW2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Psme4Q5SSW2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Psme4Q5SSW2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Psme4Q5SSW2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Psme4Q5SSW2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Psme4Q5SSW2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms