Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Utp18Q5SSI6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Utp18Q5SSI6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Utp18Q5SSI6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Utp18Q5SSI6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Utp18Q5SSI6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms