Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rbm27Q5SFM8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbm27Q5SFM8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rbm27Q5SFM8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rbm27Q5SFM8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rbm27Q5SFM8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms