Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hs3st6Q5GFD5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hs3st6Q5GFD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hs3st6Q5GFD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hs3st6Q5GFD5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hs3st6Q5GFD5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms