Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrc8bQ5DU41 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc8bQ5DU41 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc8bQ5DU41 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc8bQ5DU41 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc8bQ5DU41 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms