Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sfmbt2Q5DTW2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sfmbt2Q5DTW2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms