Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim26Q3V460 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim26Q3V460 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim26Q3V460 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim26Q3V460 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim26Q3V460 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim26Q3V460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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