Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm906Q3V0M1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm906Q3V0M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm906Q3V0M1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm906Q3V0M1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms