Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc27Q3V036 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccdc27Q3V036 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ccdc27Q3V036 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc27Q3V036 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc27Q3V036 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms