Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn4Q3UV66 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slfn4Q3UV66 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slfn4Q3UV66 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn4Q3UV66 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slfn4Q3UV66 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn4Q3UV66 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn4Q3UV66 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms