Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B230104I21RikQ3USW4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B230104I21RikQ3USW4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
B230104I21RikQ3USW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
B230104I21RikQ3USW4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms